Если крафтить корабль в коробке "сделай сам", то его можно передать/продать другим игрокам. Корабль, крафченый по обычному чертежу, можно использовать только самому, так как он будет непередаваемым. Однако, на чертежный корабль распространяется навык "Качество" в крафте, в отличие от корабля в коробке - характеристики корабля в коробке определяются рандомно в момент открытия.
Вывод: для себя корабль лучше крафить по чертежу, если прокачан навык "Качество" (хотя бы на 2 пункта); на продажу корабли нужно крафтить в коробке.